Pour convertir une FAT 32 en NTFS, il vous faut avoir un seul system d'exploitation présent (ne pas avoir de multiboot).

Allez dans Démarrer/Exécuter et tapez Convert [lecteur]: /FS:NTFS

Remplacer [lecteur] par la lettre de votre lecteur (en général C).

Vous n'aurez pas de gains de performance, mais un système plus sécurisé